Le style de Botticelli est unique parmi ses pairs de la Florence de la fin du XVe siècle : des figures apparemment sans os et sans ombres, avec une élégance décorative qui ne ressemble pas au réalisme des autres artistes. Si vous regardez de près, vous verrez qu'il soulignait les visages et les corps d'une fine ligne noire, une technique qu'il a transmise à son élève Filippino Lippi.
Botticelli ne s'est jamais marié et a exprimé une forte aversion pour l'idée du mariage, une perspective qui, selon lui, effrayante. On dit qu'il a souffert d'un amour non partagé pour Simonetta Vespucci. Selon la croyance populaire, la noble mariée a été le modèle pour la Naissance de Vénus, malgré le fait qu'elle soit morte des années auparavant. Elle est également représentée dans un portrait très flatteur aux Uffizi.
Botticelli est connu pour ses œuvres mythologiques et ses portraits profanes, mais il était très religieux et il a produit plus de tableaux de madones et de retables que toute autre chose. Dans sa vieillesse, Botticelli est l'un des disciples du frère Savonarola, profondément moraliste, qui prêche à Florence de 1490 à son exécution en 1498. Après la mort de Savonarola, Botticelli n'a plus jamais été le même : « Il a été incité à abandonner sa peinture, et, n'ayant aucun revenu pour vivre, il est tombé dans une très grande détresse. » (G. Vasari). En 1491, il fait partie d'un comité chargé de décider de la façade de la Cathédrale de Florence. Ses idées étaient tenues en très haute considération, car bien que vieux et pratiquement inactif, Botticelli figure en 1504 parmi les membres du comité chargé de choisir l'emplacement le plus approprié pour le David de Michel-Ange.
Botticelli est enterré à Florence, dans l'église d'Ognissanti, où il y a aussi une petite fresque de Saint Augustin dans son bureau.
À l'époque moderne, son héritage est porté jusque dans l'espace : un cratère d'impact à la surface de la planète Mercure est appelé Botticelli en son honneur.
