En plus de relier d'importants édifices religieux tels que la Basilique de Santa Croce à Florence et la Basilique d'Assise, la Via di Francesco est ponctuée de nombreux lieux de culte, entre nature et spiritualité. Des coins intimes de silence et de prière entourés de forêts sacrées et majestueuses comme le sanctuaire franciscain de l’Alverne, parmi les plus connus, - mentionné par Dante dans le Paradis, Chant XI (106 - 108) - et le monastère et l’ermitage de Camaldoli. D'autres coins, moins connus mais non moins fascinants, conservent des histoires et des œuvres d'art à découvrir pas à pas, et dans certains cas, sont des lieux d'hospitalité sur le chemin de pèlerinage
La Via di Francesco, imprégnée de mysticisme et de nature sauvage, peut être définie comme la route des ermitages les plus évocateurs d'Italie.
Niché dans les étendues verdoyantes du Casentino riches en bois de hêtres et de sapins couvrant la chaîne des Apennins toscans, le sanctuaire franciscain de l'Alverne s'élève du Mont Penna, bien visible depuis les territoires environnants du Casentino et de la haute Valtiberina (Alta Valtiberina). C’est le lieu où Saint François a reçu les stigmates, donc l'un des plus importants sanctuaires franciscains.
Le complexe comprend la petite église de Santa Maria degli Angeli construite par François lui-même, un charmant couloir bordé de vitraux d'un côté et de fresques de l'autre ; la chapelle des Stigmates, ainsi que la Basilique de Santa Maria Assunta qui abrite l'Annonciation, l'un des chefs-d'œuvre du sculpteur Andrea della Robbia. Sasso Spicco est un autre lieu fascinant : c’est un imposant rocher suspendu, coincé au fond d'une gorge, auquel on accède par un petit escalier.
Dans le parc national des forêts du Casentino, Mont Falterona et Campigna, d'autres perles religieuses se frayent un chemin à travers les forêts sacrées de hêtres et de sapins : le monastère et l'ermitage de Camaldoli. Fondée en 1012 par le moine bénédictin Saint Romuald, la ville de Camaldoli abrite deux établissements religieux principaux : le monastère (qui est rattaché à un « hospice », à une ancienne pharmacie et à une église qui abrite cinq admirables tableaux de Giorgio Vasari) et, à environ trois kilomètres, l'ermitage sacré, situé à environ 1 100 mètres d'altitude, près de la crête des Apennins, à la frontière avec la Romagne.
Dépositaire d'un important patrimoine artistique et embrassée par les splendides bois dans les environs de Reggello, l'abbaye de Vallombrosa est un majestueux complexe monastique de paix qui organise de nombreuses activités religieuses et culturelles, tout en accueillant les fidèles et les pèlerins. Les moines vallombrosiens produisent de nombreux produits à base de plantes, dont des liqueurs aux propriétés bénéfiques reconnues.
Élevée au rang de basilique mineure en 1950, l’abbaye est un monument national italien.
Situé dans la localité portant le même nom, près du village historique de Bibbiena, le sanctuaire de Santa Maria del Sasso est un lieu de culte qui a reçu le titre honorifique de basilique mineure, accordé par le pape Pie XII en 1942. Il abrite d'importantes œuvres d'art de l'école florentine telles que la Madone del Buio et une terre cuite de Mattia della Robbia.
Le couvent est construit autour d'un cloître spacieux avec un portique à quatre côtés et des lunettes décorées à fresque au XVIIIe siècle avec les miracles de la Madonna del Sasso.
Lieu de prière infranchissable et de spiritualité, l'ermitage de Cerbaiolo est perché sur un éperon rocheux et niché au milieu de la nature dans les environs de l’église paroissiale Pieve Santo Stefano en Valtiberina. Il rappelle le sanctuaire de l'Alverne, bien qu’il soit plus petit, et offre des panoramas splendides des environs.
L’établissement a ensuite été donné à saint François et les frères mineurs franciscains y ont ensuite vécu de 1216 à 1783. Dans son histoire la plus récente, l'ermitage a été le théâtre de violents combats entre les troupes allemandes et les partisans pendant la Seconde Guerre mondiale.
Fondé par saint François en 1213, le couvent de Montecasale, en réalité, lui a été conféré et date du XIe siècle. Son emplacement est situé dans les magnifiques environs de Sansepolcro. C’est un exemple remarquable d'architecture pauvre, ainsi qu’un fascinant édifice religieux immergé dans les bois de la Valtiberina, qui présente encore les traits caractéristiques des anciens couvents franciscains.
À deux pas du splendide village artistique et historique de Cortona, l'ermitage franciscain Le Celle est un lieu de paix intérieure et de nature mystique avec des vues très évocatrices. Bâtiment sacré où règne le silence et voué à la recherche de Dieu, c'est bien le premier couvent fondé par saint François en 1211.
Certains espaces sont utilisés pour accueillir des groupes de personnes qui souhaitent y passer une période limitée de retraite spirituelle.