La présence d'une communauté juive à Pitigliano est attestée depuis le XVe siècle. Celle-ci habitait la partie sud de la ville : dans l'actuelle Via Zuccarelli, vous pouviez trouver en 1622 le ghetto, ainsi que la synagogue, des magasins et des ateliers d'artisanat.
Au XIXe siècle, la communauté est devenue si nombreuse que le village a reçu le surnom de « Petite Jérusalem ». Cependant, à la suite de l'unification de l'Italie, de nombreuses familles ont quitté la région pour s'installer dans d'autres villes italiennes.
Aujourd'hui, dans la Petite Jérusalem de la Maremme vous pouvez visiter le Musée juif, installé dans le bâtiment qui fut le premier lieu de culte et d'étude de la colonie juive. La synagogue actuelle a été construite au-dessus en 1598, puis endommagée par l'effondrement partiel de la roche de tuf dans les années 1960. Restauré en 1995, il est aujourd’hui ouvert aux visiteurs.
La pinacothèque contient de nombreux objets du culte juif et constitue le point d'entrée pour la visite du temple et l'itinéraire dans l'ancien ghetto de Pitigliano avec le bain rituel, la cave Kasher et l'abattoir, le four à pain azyme et la teinturerie.