La fondation du monastère de Santa Chiara di San Miniato remonte à 1226. Pendant des siècles, il a été habité par les Clarisses, jusqu'à ce qu'il soit transformé en école pour l'éducation des jeunes filles lors de la suppression des ordres religieux en 1785. Aujourd'hui, quelques pièces de l'ancien couvent peuvent être visitées (notamment l'ancien chœur des religieuses), ainsi que l'église à l’extérieur et la chapelle dédiée à Sainte Marie-Madeleine.
La riche collection que l'on peut voir s'est constituée au fil des siècles grâce aux dots des religieuses, aux dons faits par les familles des Clarisses et aux travaux réalisés par les religieuses elles-mêmes.
L'église est ornée de précieuses décorations du XVIIe siècle réalisées par l'atelier du peintre Antonio Domenico Bamberini. La partie interne abrite un certain nombre de peintures remarquables : un panneau de la fin du XVIe siècle sur le maître-autel, une peinture de l'Immaculée Conception de Iacopo Chimenti appelé également Empoli ; un panneau du XVIIe siècle provenant de l'atelier de Simone Pignoni ; et une peinture de Pier Francesco Foschi représentant le Christ mort soutenu par des anges. Vous y trouverez également un reliquaire de Saint Craton le martyr, offert à cette communauté de religieuses par le pape Alexandre VII.
Il y a d’autres chefs-d'œuvres, notamment des peintures, des urnes, du mobilier liturgique et des travaux de broderie réalisés par les religieuses, comme certains frontaux en soie. Outre la belle peinture de Ludovico Cardi dit Cigoli, le mobilier est également intéressant, comme les deux crucifix médiévaux : le premier est signé par Deodato Orlandi et daté de 1301, le second par le siennois Jacopo di Mino del Pellicciaio (vers 1340).